Het bestuur van de Stichting Fonds NRC Handelsbladlezers bestond tot 20 maart 2018 uit de directeur en de hoofdredacteur van de krant alsmede mr. E. IJ. Spier, oud-notaris te Amsterdam.
Het was de wens van hoofdredactie en directie van NRC Media om het bestuur van de Stichting in bestuurlijke zin los te maken van de kranten, maar tegelijkertijd de innige band die er 90 jaar met de Stichting en haar Raad van Advies in de vorm van de Commissie van NRC Handelsbladlezers bestaat, te bestendigen. Daartoe is op 20 maart 2018 tussen NRC en Stichting een Convenant gesloten waarin afspraken zijn gemaakt over de ondersteuning van de fondsenwerving, de advertentiecampagne voor de jaarlijkse Kerstactie, de samenwerking met betrekking tot de website en de jaarlijkse financiële ondersteuning zijn vastgelegd.
Het huidige bestuur wordt gevormd door:
H. Itzig Heine, voorzitter
G.J. Sonneveld, secretaris/penningmeester
Mr. E.O. Spier, lid
Over de besteding van de giften adviseert de Commissie van NRC Handelsbladlezers tweemaal per jaar.
Het huidige bestuur wordt sinds 5 november 2021 gevormd door: